Recebi alguns e-mails com esta dúvida, e fui atrás de respostas :-) Consegui localizar o fórum oficial do GUIReplacer, e lá tem um tópico sobre o referido assunto. Segundo o autor (o Fizical), não há problemas de incompatibilidade; entretanto, alguns users relataram problemas, não com o programa em si, mas com alguns módulos, e comentou-se muito sobre a dll user32.dll.
Se você sabe inglês, e estiver afim de acompanhar a discussão mais de perto, o link é este abaixo:
Windows XP SP2 e GUIReplacer
Troque os ícones com o GUIReplacer (tutorial)
